排污許可證是國家對在生產經營過程中排放廢氣、廢水、產生環境噪聲污染和固體廢物的行為實行許可證管理，以期加強對污染源的監督管理及控制。

在歐美發達國家，排污許可證是最重要的環境管理制度之一，是執法檢查的重要依據。于20世紀70年代最早在瑞典得以應用。

我國排污許可的實施可以追溯到1985年，最初從上海的水污染物排放許可證上得到應用，30年來，浙江、江蘇、內蒙古、四川等25個省份均不同程度的制定了相關法規，占比超八成。2004年，原國家環境保護總局(現環保部)便在唐山市、深圳市、沈陽市、杭州市、銀川市、武漢市等六市開展排污許可證試點工作。一路走來，排污許可證制度在我國推行三十年，總計向約24萬家企事業單位發放了排污許可證，成效是有的；但卻存在"推而不廣"的尷尬。 許可證的運行原理看起來似乎并不復雜，但難點就在于，按我們以往對企業的環保管理要求和不同環保職能部門的管理的"套路"，根本就做不到能把"所有"要求邏輯清晰、貫穿如一地"放進"同一個許可證里。 長久以來的這些環保要求，不僅是"分散"成多套數據形式，長著"多張皮"的，甚至還經常是互相"打架"的。環境統計、總量核查、環評批復、"三同時"、排放標準要求、清潔生產要求、排污收費……各自是一套，分別對口不同的業務司局處室。當然，環保局給企業發的那么多憑證中，也曾有個名稱叫做"排污許可證"的，跟上述管理制度之間也沒有必然聯系，就是一張寫明被分配的總量的憑據而已。 因為各自為政，缺乏有機銜接和統一，也就導致了多年來不斷"盲人摸象"，行政效能卻還不高的結果。經常是該管理的沒有管到位，環境家底、污染源依然是一筆糊涂賬;不該管的卻管過了頭，管成了管理者和企業雙方的沉重負擔。 總體來看，排污許可制還存在在環境管理制度中核心基礎地位不明確，在推動企事業單位落實治污主體責任方面發揮的作用不突出，環保部門依證監管不到位，各地要求不統一的尷尬點。