通過本項目實施，總體上實現我國水污染控制與治理關鍵技術及制約因素的實質性突破，建立和完善適合我國國情的水污染控制與治理工程技術體系與監管體系，完善決策與監管所需的基礎數據系統，以大幅度提高政府及全社會應對水環境問題的決策、監管和服務能力，促進體制與機制的理順、市場規則的健全，全面引導和促進行業整體水平和企業競爭力的提高，為我國水環境治理與改善提供強有力的支撐。
項目總經費250000萬元，其中申請國撥資金100000萬元，項目承擔單位自籌150000萬元。項目實施周期為5年，2006年～2010年按實施條件成熟情況，逐步展開，同時兼顧長遠規劃，實施逐年調整與滾動機制，保障項目實施的實效性和延續性。