（三）改革水價形成機制
水價長期偏低和征收不全，既助長了水的浪費，又使供水、水利經營等單位入不敷出，得不到良性發展。
水價的涵義歷來存有爭議，現在對水價的內涵研究有所深化，概括起來，水價包含三方面內容：一是資源水價，即取用水資源要繳納水資源費，體現國家對水資源的權屬管理；二是工程水價，包括供水成本、合理利潤和稅收；三是環境水價，包括已開征的排污費、超標排污費、居民生活污水處理費以及正在考慮開征的保護水資源及生態環境補償費。
水價改革的效果是比較明顯的。如2000年寧夏農業用水價格由每方水6厘提高到每方12厘，當年就少引黃河水9億m3。
（四）加強科技創新，推進水利現代化進程
新時期的水利工作正在經歷由傳統水利向現代水利的深刻轉變，需要依靠科技進步和體制創新，促進水利建設現代化。“十五”期間和21世紀初期重點是要建立流域和區域防洪、水資源管理調度中心和水土保持監測中心，實現防洪科學指揮調度與水資源優化和實時調度。
有關水資源的管理體制、運作機制改革的問題較多，也非常復雜，需要通過立法和制度建設予以解決。目前全國人大、國務院法制辦正在組織修訂《水法》，已征求了有關部門和地區的意見，水利部也正在組織力量對有關問題進行研究。相信通過《水法》的修訂和一些制度的建立，體制問題和機制問題將會逐步得到理順和解決。我國水資源開發利用和保護管理，將全面走向依法治水、科學治水的道路，將更好地適應社會主義市場經濟發展的需要，實現水資源可持續利用，保障經濟社會的可持續發展。